親水色譜柱是一種直接分離極性和親水性化合物的色譜技術(shù)，為了便于理解，我們可以把它看作為是一種用反相色譜溶劑作流動相的正相色譜。因此，HILIC是親水性的流動相，以水、有機溶劑和緩沖鹽作為流動相。常見的HILIC方法采用50%~90%有機溶劑和一定比例的水，并且含有低濃度的緩沖鹽。如乙腈/水/醋酸銨體系。在HILIC方法中，洗脫順序和反相色譜正好相反，即極性越大，保留時間越長。
1、樣品是極性的且弱酸性的；就可以選擇C18在100%酸性水溶液條件下檢測，即要選擇承受100%純水且對極性化合物保留很好的親水色譜柱。
2、如果樣品極性太強，或酸性太強；可以選擇CN，NH2，或硅膠柱，HILIC（親水色譜），也有使用C18+強陰離子對試劑或強陰離子交換親水色譜柱（缺點是離子對試劑平衡時間長，對流動相pH要求比較精密，否則很難重復實驗，另外離子對試劑很難洗下來，基本上用了離子對的親水色譜柱就不能再用于其它實驗）。
3、若樣品是堿性的；可選擇高純硅膠柱（高純硅膠缺少金屬雜質(zhì)，且硅膠端基封尾）或一些經(jīng)過修飾的C18柱（如極性嵌入技術(shù)或堿去活技術(shù)等），他們都會減少堿性化合物的拖尾，一般會選擇中性或偏堿的條件下做，因為這樣可增加堿性樣品的保留。
4、如果堿性化合物的極性太強，或堿性太強；可以選擇寬pH的C18色譜柱在高pH值檢測（優(yōu)點是方法開發(fā)簡單，缺點是目前實現(xiàn)這一技術(shù)的色譜柱品牌比較少，價格也高）或者選用HILIC色譜柱（硅膠柱在反相條件下使用，這也是很經(jīng)典的檢測堿性樣品的方法）選擇強離子交換柱（缺點是不能用來分析其它樣品，對流動相pH要求比較精密，否則很難重復實驗）也有使用C18+強陰離子對試劑或強陰離子交換親水色譜柱。
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